未分類 RNA-seq解析入門③：トリミング編
この記事では、クオリティチェックの次のステップである「トリミング」について解説します。トリミングとは何かという概念から、fastp・Trimmomatic・Cutadapt・BBDukの4ツールの特徴と使い分け、そしてCutadaptを使っ...
未分類 未分類 FastQC環境構築編（Linux環境・Conda版）
この記事では、Linux環境においてCondaを使ったFastQCのインストール方法をステップごとに解説します。Biocondaチャンネルの追加からインストール、動作確認まで、コマンドをコピーして順番に実行するだけで環境を整えることができま...
未分類 RNA-seq解析入門②：クオリティチェック編
この記事では、RNA-seq解析の最初のステップであるクオリティチェックについて解説します。なぜクオリティチェックが必要なのかという概念から、FastQC・MultiQC・Falcoの3つのツールの特徴と使い分け、FastQCの具体的な使い...
未分類 RNA-seq解析入門①：解析の全体フローとツール選びの考え方
この記事では、RNA-seq解析の全体的な流れと、各ステップで登場するツールの概要を紹介します。「どのツールを選べばいいかわからない」という初学者の疑問に答えるため、ツール選びの3つの観点と、最初に試すべき基本セットを解説します。またRNA...