2026-04

MCPの普及に伴い、バイオインフォマティクス・生命科学分野向けのMCPサーバーが続々と公開されています。この記事では、現時点で利用可能な主要なバイオインフォ系MCPサーバーをカテゴリ別にまとめて紹介します。💡この記事を読む前にMCPが何かを...

「MCP」という言葉を最近よく見かけるようになりましたが、「何のことかよくわからない」という方も多いのではないでしょうか。この記事では、MCPとは何か・なぜ必要なのか・どんなことができるのかを、プログラミングの知識がない方にもわかるようにゼ...

この記事では、カウントマトリクスをもとに「どの遺伝子が条件間で発現量が変化しているか」を統計的に検定する「発現変動解析」について解説します。DESeq2・edgeR・limma-voomの3ツールの特徴と使い分け、DESeq2を使った実践コ...

この記事では、マッピング後のBAMファイルから遺伝子ごとのリード数を集計する「カウント」について解説します。BAMベースのfeatureCounts・HTSeq-countと、アラインメントフリーのSalmon・Kallistoの4ツールの...

この記事では、トリミング後のリードデータをゲノムに対応づける「マッピング」について解説します。HISAT2・STAR・Bowtie2・TopHat2の4ツールの特徴と使い分け、そしてSTARを使った実践コードの読み方まで、初学者にもわかりや...

この記事では、クオリティチェックの次のステップである「トリミング」について解説します。トリミングとは何かという概念から、fastp・Trimmomatic・Cutadapt・BBDukの4ツールの特徴と使い分け、そしてCutadaptを使っ...

この記事では、Linux環境においてCondaを使ったFastQCのインストール方法をステップごとに解説します。Biocondaチャンネルの追加からインストール、動作確認まで、コマンドをコピーして順番に実行するだけで環境を整えることができま...

この記事では、RNA-seq解析の最初のステップであるクオリティチェックについて解説します。なぜクオリティチェックが必要なのかという概念から、FastQC・MultiQC・Falcoの3つのツールの特徴と使い分け、FastQCの具体的な使い...

この記事では、RNA-seq解析の全体的な流れと、各ステップで登場するツールの概要を紹介します。「どのツールを選べばいいかわからない」という初学者の疑問に答えるため、ツール選びの3つの観点と、最初に試すべき基本セットを解説します。またRNA...