Claude Science は、文献検索・データベース参照・コード実行・作図までを1つの環境にまとめた研究者向けのアプリです。2026年6月30日にベータ公開されました。
Mac 版はインストーラをダブルクリックするだけで導入でき、端末での準備作業は必要ありません。この記事では、導入から最初の解析までを順に解説します。
1. Claude Science とは何か
これまで研究者は、文献を探すブラウザ、コードを書く Jupyter、計算を投げる端末、というように複数のツールを行き来していました。Claude Science はこれらを1つの作業環境にまとめ、自然言語での指示から解析の実行までを一続きで扱えるようにしたアプリです。
公式の説明では、自然言語で解析内容を伝えると、Claude が Python・R・シェルのコードをサンドボックス(隔離された領域)の中で書いて実行し、許可したフォルダを読み、コネクタ経由で科学データベースからデータを取得し、結果を来歴(どう作られたかの記録)付きのアーティファクトとして保存する、とされています。
バイオインフォマティクス的に押さえておきたいのは次の3点です。
- 60を超える公開データベースに接続済み:Ensembl・UCSC・UniProt・GO・Reactome・gnomAD・ClinVar・GTEx・ENCODE・JASPAR・PDB・AlphaFold・GEO などに、各データベースの問い合わせ言語を覚えずに自然言語でアクセスできます。
- 解析手法が skill として同梱:AlphaFold2・OpenFold3・ESM-2・Evo 2・Borzoi・scGPT・scvi-tools などが呼び出せる状態で用意されています。
- 出力にコードと実行環境が紐づく:生成された図には、それを作ったコード・環境・作成手順の説明・全メッセージ履歴が付随します。数か月後に自分の図を再現・検証できる状態が保たれます。
接続部分の仕組みは MCP(Model Context Protocol)です。MCP そのものについては MCPとは何か と バイオインフォ系MCPサーバー完全ガイド を参照してください。DBCLS の生命科学データベースを扱う TogoMCP も同じ枠組みです。
2. 動作要件
Mac で必要なものは4つだけです。
| 項目 | 要件 |
|---|---|
| Claude のプラン | Pro / Max / Team / Enterprise のいずれか |
| OS | macOS 13 以降 |
| CPU | Apple シリコン・Intel のどちらでも可 |
| 空きディスク | 約 5 GB(実行環境と初期パッケージ用) |
組織の管理者が Claude Science を有効化しないと、サインインの段階で止まります。所属機関の契約で使う場合は、先に管理者に有効化を依頼しておいてください。個人の Pro / Max プランであればこの手続きは不要です。
Linux では、コードを隔離して実行するための道具を別途導入する必要があります。Mac ではこれが不要で、インストーラがすべて用意します。既存の conda 環境・R のライブラリ・シェルの設定にも手を加えません。
3. 導入から最初の解析までの流れ
全体の流れは次のとおりです。作業そのものは短く、待ち時間の大半は初回の環境準備です。
4. 手順① インストーラを入手して実行する
公式の製品ページからインストーラをダウンロードし、ダブルクリックします。
text
https://claude.com/product/claude-science
導入が終わったら、アプリを起動します。初回起動では、実行環境と Python・R の初期パッケージの準備が走ります。数分かかり、約 5 GB のディスクを使います。準備が終わると、既定のブラウザに新しいタブが開きます。
メニューバーのアイコンから Open を選んでください。Claude Science はブラウザのタブに表示されますが、Web サービスではなく Mac の中で動いているローカルアプリです。そのため、URL を入力して辿り着くことはできません。タブを閉じてしまった場合も、同じくメニューバーのアイコンから開き直します。
5. 手順② サインインする
開いたタブで、Claude アカウントでサインインします。API キーは必要ありません。普段 Claude を使っているアカウントでそのまま入れます。
原因は3つのいずれかです。
(1)アカウントが無料プランのままである(有料プランへの変更が必要)
(2)認証後の戻り先にたどり着けていない。この場合はサインイン画面の Paste a code を選び、表示されたコードを貼り付ける方式に切り替えます
(3)Team・Enterprise で、組織側の有効化がまだ済んでいない
6. 手順③ セットアップウィザードで初期設定する
サインインすると、初期設定のウィザードが始まります。ここで決めるのは次の3点です。
- コネクタ:どの外部データベースに接続するか。公開データベース向けのものは既定で有効になっており、読み取り専用でアカウントやキーは不要です。
- skill:どの解析手法を読み込めるようにするか。
- アクセスできるサイト:Claude がどの Web サイトに接続してよいか。
いずれも後から設定画面で変更できるので、迷ったら既定のまま進めて構いません。
接続先の公開データベースには、非商用限定や出典表示を求めるものが含まれます。利用条件を満たしているかの確認は利用者の責任とされているため、研究成果として公表する際は、使ったデータベースのライセンスを個別に確認してください。
7. 手順④ 最初の解析を実行する
設定が終わったら、実際に動かしてみます。手順は次のとおりです。
- 用意されている Example プロジェクトを開くか、新しいプロジェクトを作る。
- 会話を開始する。解析したいフォルダは、パスを直接入力するか、入力欄の @ から選ぶ。
- フォルダへのアクセス許可を尋ねるカードが出るので、内容を確認して許可する。
- Claude がコードの実行を提案すると、実行許可を尋ねるカードが出るので、これも確認して許可する。
- 結果は Files パネルにアーティファクトとして表示される。
Claude Science は、新しいフォルダ・接続先・外部の計算資源を使う前に、必ず利用者の承認を求める設計になっています。解析対象のファイルは Mac の中に置かれたままで、勝手に読まれることはありません。承認した内容は後から取り消すこともできます。
最初の1回は、手元の小さなデータで試すことをおすすめします。AnnData 形式 のファイルなど、読み込みと品質管理まで済ませた、内容を自分で把握しているデータを使うと、出力が正しいかどうかを自分で判断できます。
8. データの置き場所
Claude Science が作るものは、すべてホームディレクトリ直下の1つのフォルダにまとまります。
bash
# プロジェクト・アーティファクト・会話履歴の保存先
ls ~/.claude-science
プロジェクト・アーティファクト・会話履歴がすべて失われます。アプリごと削除する場合も同様です。残したい解析結果がある場合は、先に別の場所へ書き出しておいてください。
9. 使い始める前に知っておくこと
公式ドキュメントには、次の注意が明記されています。導入直後に把握しておくべき内容です。
- Claude は間違えることがある。出力を検証する reviewer の仕組みは誤りを減らしますが、無くすものではありません。
- reviewer は解析を再実行しない。実行記録に照らして主張を突き合わせるだけです。つまり、実行そのものが誤っていた場合は検出できません。
- 研究・出版・下流の判断に使う前に、結果を自分で検証する必要がある。
- 研究用ツールであり、臨床用途・診断用途は想定されていない。
解析の生物学的な妥当性を判断するのは、これまでどおり研究者の側です。手順が定まっている作業を速くするツールとして使い、結論の正しさは従来と同じ基準で確かめる、という使い方が現実的です。
まとめ
- Claude Science は、文献・データベース・コード実行・作図を1つにまとめた研究者向けアプリで、macOS と Linux でベータ公開されている。
- Mac の要件は、有料プラン・macOS 13 以降・Apple シリコンまたは Intel・空き 5 GB の4点のみ。
- 導入はインストーラをダブルクリックするだけで、端末での準備作業は不要。
- 初回起動で Python と R の環境準備に数分かかり、終わるとブラウザのタブが開く。
- ブラウザに表示されるがローカルアプリであり、URL では辿り着けない。閉じたらメニューバーのアイコンから開き直す。
- サインインに API キーは不要。Team・Enterprise では管理者による有効化が先に必要。
- フォルダの利用とコードの実行は、その都度カードで承認する方式になっている。
- データは
~/.claude-scienceにまとまる。削除すると解析結果ごと失われる。 - reviewer は解析を再実行しないため、結果の検証は従来どおり利用者が行う。
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参考文献
- Anthropic. (2026, June 30). Claude Science, an AI workbench for scientists, is now available. https://www.anthropic.com/news/claude-science-ai-workbench
- Anthropic. (2026). Claude Science documentation: Overview and requirements. https://claude.com/docs/claude-science/overview
- Anthropic. (2026). Claude Science documentation: Get started. https://claude.com/docs/claude-science/get-started
- Anthropic. (2026). Claude Science documentation: Connectors and skills. https://claude.com/docs/claude-science/connectors-and-skills
- Ashuach, T., Reidenbach, D. A., Gayoso, A., & Yosef, N. (2022). PeakVI: A deep generative model for single-cell chromatin accessibility analysis. Cell Reports Methods, 2(3), 100182. doi:10.1016/j.crmeth.2022.100182
- Wolf, F. A., Angerer, P., & Theis, F. J. (2018). SCANPY: large-scale single-cell gene expression data analysis. Genome Biology, 19, 15. doi:10.1186/s13059-017-1382-0


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