Claude Science からラボの計算機を使う ─ SSH でジョブを投げる

Claude Science は既定では、動かしているパソコンの中で解析を実行します。軽い解析ならこれで足りますが、メモリが必要な処理や GPU を使うモデルは手元では回りません。

導入がまだの場合は、お使いの環境に合わせて Linux・Mac・Windows（WSL2） の各記事を先に済ませてください。

そこで、SSH で届く計算機を登録してジョブだけ外へ出す機能が用意されています。リモート側には Claude Science をインストールしません。既存の ~/.ssh/config をそのまま使い、鍵か ssh-agent で認証します。

1. 何がどこで動くのか

手順に入る前に役割分担を押さえておくと、後の注意点が理解しやすくなります。

会話・計画・図の作成は手元で行われ、重い計算だけがリモートで動きます。ジョブが終わると結果が手元のセッションに戻り、そのまま図にできます。

重要なのは、大きなデータを動かさずに済むことです。シーケンスデータがラボの計算機にあるなら、ジョブはそこで直接読み書きします。既定では約 100 MB を超えるファイルはリモートに残り、Claude はその場所だけを記録します。

2. 前提：SSH が通ること

先に、手元から目的の計算機へ普通に SSH で入れる状態にしておきます。

bashコピー
# 鍵をまだ作っていない場合
ssh-keygen -t ed25519

# 公開鍵を相手側に登録する
ssh-copy-id user@192.168.1.50

# パスワードなしで入れることを確認する
ssh user@192.168.1.50

3. 手順① ~/.ssh/config に別名を書く

Claude Science は ~/.ssh/config の別名を読みます。アドレス・ユーザー名・ポート、そして踏み台を経由する場合の ProxyJump は、すべてこのファイルから取得されます。

textコピー
# ~/.ssh/config

# ラボのワークステーション
Host lab
    HostName 192.168.1.50
    User user

# 踏み台を経由する場合
Host hpc
    HostName login.hpc.example.jp
    User user
    ProxyJump gateway

別名を書いておけば、以降は ssh lab だけで接続できます。この別名をそのまま Claude Science に登録します。

4. 手順② ホストを登録する

Settings > Compute > SSH hosts > Add SSH host を開き、~/.ssh/config の別名を選ぶか入力します。

ここでホストについての注記を書いておけます。使うパーティション、アカウントコード、読み込むモジュール、ソフトを入れてよいかどうか、といった内容です。Claude は最初のジョブを投げる前にこれを読みます。

ユーザー名・ポート・鍵ファイルを個別に上書きしたい場合は、Advanced から指定できます。指定が済んだら Add を押します。

5. 手順③ 作業領域と同時実行数を決める

ホストの詳細ページで、次の2つを設定します。

6. ジョブを投げる

Claude がリモートでの実行を提案すると、Run this job on <host>? というカードが表示されます。実行されるコマンドとスクリプトがそこに出るので、内容を読んでから承認します。

承認の範囲は4段階から選べます。

• Once — 今回のジョブだけ
• This conversation — この会話の中では以降も許可
• This project — このプロジェクト内で許可
• Global — すべての場面で許可

承認すると、ジョブスクリプトと入力がスクラッチ領域の下のジョブ用ディレクトリにコピーされ、実行されます。終わると結果が手元のセッションに戻ります。

7. ホストごとの作法を覚えさせる

ホストの詳細ページには Details というドキュメントがあり、Claude はここからそのホスト固有の指示を読みます。

書いておく内容は、環境の有効化方法、データやパッケージの置き場所、スケジューラの慣習といったものです。Claude は作業しながらこれを更新し、こちらからも随時編集できます。

たとえば、次のような内容を書いておくと初回から噛み合います。

textコピー
# Details に書いておくとよい内容の例

conda は /opt/miniconda3 にある。source /opt/miniconda3/bin/activate で有効化する
解析用の環境名は scanpy-env
解析データは /data3/projects/ 以下。ここ以外には書き込まない
GPU は 1 枚のみ。同時に GPU ジョブを 2 つ走らせない
パッケージの新規インストールは事前に相談すること

8. 使いどころ

この機能が効くのは、次のような場合です。

• 手元のメモリでは足りない解析：大きな AnnData を読み込む処理や、多検体の scRNA-seq 前処理、scATAC-seq のピーク呼び出しなど
• GPU が必要な処理：scvi-tools による統合や、構造予測モデル
• データが計算機側にある場合：シーケンスデータを移動させずに、その場で処理できる
• 時間のかかるパイプライン：投入して接続を切っても走り続ける

逆に、データベースの横断検索や文献調査、図の調整は手元で完結するため、リモートを使う必要はありません。手順が定まっている作業を skill として登録しておくと、マルチオミクス解析 のような多段階の処理でも同じ手続きを再利用できます。

まとめ

• SSH で届く計算機を登録すると、Claude Science から解析ジョブを投げられる。リモート側に Claude Science は導入しない。
• 接続情報は ~/.ssh/config から読まれる。別名・ProxyJump を先に整えておく。
• 登録は Settings > Compute > SSH hosts > Add SSH host。追加時に読み取りのみの調査が走り、CPU・メモリ・GPU・スケジューラの有無が記録される。
• ワークステーションでは独立プロセス、SLURM では sbatch でジョブが走る。接続が切れても継続する。
• 投入前に承認カードが出る。範囲は Once / This conversation / This project / Global の4段階。
• リモートのジョブはサンドボックスの外で、自分のアカウントとして動く。コマンドを読んでから承認する。
• 既定のタイムアウトは30分。長い処理は事前に伝える。
• 結果は手元に戻るが、約 100 MB を超えるファイルはリモートに残り、場所だけが記録される。
• ホストごとの作法は Details ドキュメントに書いておくと、初回から噛み合う。

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参考文献

• Anthropic. (2026). Claude Science documentation: Remote compute clusters. https://claude.com/docs/claude-science/remote-compute-clusters
• Anthropic. (2026, June 30). Claude Science, an AI workbench for scientists. https://www.anthropic.com/news/claude-science-ai-workbench
• Anthropic. (2026). Claude Science documentation: Overview and requirements. https://claude.com/docs/claude-science/overview